安装 EMBOSS 及 transeq 工具
EMBOSSEuropean Molecular Biology Open Software Suite是一个生物信息学工具集包含多个用于分子生物学分析的工具其中transeq用于将 DNA 序列转换为蛋白质序列。1. 解压并安装 EMBOSS首先下载并解压 EMBOSS 包tar -xvf emboss-6.6.0.tar.gz然后配置并安装 EMBOSS./configure --prefix$(pwd)/local make -j make install--prefix$(pwd)/local会将 EMBOSS 安装到当前目录的local子目录下。2. 临时添加到 PATH如果只想在当前终端会话中使用transeq工具可以临时将其添加到PATH环境变量中export PATH$(pwd)/local/bin:$PATH这只会影响当前终端关闭终端后设置会丢失。3. 永久添加到 PATH如果希望在所有终端中使用transeq可以将其永久添加到PATHecho export PATH$(pwd)/local/bin:\$PATH ~/.bashrc source ~/.bashrc这会将安装路径添加到.bashrc文件中之后每次打开新终端时都会自动生效。云生信团队简介“ 云生信” 团队致力于为生命科学领域研究者提供专业的生物信息学服务 主营业务包括 定制生信分析、生信云服务器租赁及托管、生信课程、算法开发、数据挖掘、数据库开发 等服务。 团队打造的“ 云生信” 自动化分析平台 是国内首个标准化分析个性化分析的开放型生物信息学在线平台。http://www.biocloudservice.com/ 目前“ 云生信” 团队已获得40余项独立软件著作权证书 还有3项发明专利。服务领域定制分析业务 根据客户需求 订制个性化数据分析。 包含自有测序数据高级分析、公共 数据库挖掘分析 整合分析等 热点涵盖 机器学习、单细胞测序、孟德尔随机化、 网络 药理学、 GBD等临床数据库挖掘分析、分子对接及分子动力学模拟等......生信云服务器 超十年服务器深度操作经验 提供卓越服务器租赁与托管服务。 用户享受一对一技术支持软件安装、环境搭建等近20P规模服务获众多客户续费与推荐。生信课程 专注生信、 专注实操 内容涵盖单细胞、 空转、 MR等热点方向以及机器学习等 前沿技术重点讲解 热点全面 持续更新生信前沿热点。