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ApacheCN 编程/大数据/数据科学/人工智能学习资源 2019.11
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我们的所有非技术内容和活动，从现在开始会使用 iBooker 这个名字。“开源互助联盟”已终止，我们对此表示抱歉和遗憾。除非特地邀请，我们不再推广他人的任何项目。公众号自动回复已更新，添加了“轻小说/知识星球”关键词。我…
推荐ApacheCN开源的一个机器学习路线图
推荐一个ApacheCN开源的一个机器学习路线图： https://github.com/apachecn/AiLearning 注意：需要直接打开网址或者“阅读原文”才能打开文章里的链接 路线图 按照步骤: 1 > 2 > 3，你可以当大牛！ 1.机器学习 - 基础 Machine …
ApacheCN 活动汇总 2019.7.19
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欢迎大家在我们平台上投放广告。如果你希望在我们的专栏、文档或邮件中投放广告，请准备好各种尺寸的图片和专属链接，联系咸鱼（QQ 1034616238）。我们组织了一个开源互助平台，方便开源组织和大 V 互相认识…
ApacheCN 活动汇总 2019.8.3
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ApacheCN 活动汇总 2019.7.5
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ApacheCN 活动汇总 2019.8.30
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ApacheCN 翻译/校对/笔记整理活动进度公告 2019.10.18
注意
请贡献者查看参与方式，然后直接在 ISSUE 中认领。翻译/校对三个文档就可以申请当负责人，我们会把你拉进合伙人群。翻译/校对五个文档的贡献者，可以申请实习证明。请私聊片刻（529815144）、咸鱼（103461…
ApacheCN - 关于我们
1、简单介绍一下 ApacheCN？
ApacheCN 是 2016 年 8 月份就开始搭建网站雏形， 2017 年 6 月份正式全职来做，是国内第一个有组织性、敢带人装逼、敢真的分享、并且敢戴绿帽的中文开源组织。 成立 ApacheCN 是因为国内 AI 方面（包括…
ApacheCN 公众号文章汇总 2019.9
ApacheCN 优质博文推荐计划正式启动 接受以下主题的博文： 人工智能（论文解读，比赛心得，面经，知识点讲解）环材化生劝退CS 留学申请，IT 外企求职 每日从所有投稿中精选两篇，在 ApacheC…
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关于我们 | ApacheCN(apache中文网)
为什么80%的码农都做不了架构师？>>> ApacheCN | apache中文网 关于我们 一群爱装逼，爱斗图，爱吃辣条，有梦想的年轻人 、、、 我们不是资深的开源达人， 我们也不是 BAT 背景的技术大牛&#x…
5.修改fasta文件成规范文件
今天遇到一个小问题，整理的fasta参考序列并不规范，如下图所示：
碱基是小写的，并且还空行了，碱基序列不连续，那怎么变成正常的呢？（见下图） 在服务器里我们创建一个py脚本…
生信算法7 - 核酸序列Fasta和蛋白PDB文件读写与检索
python 3.9实现以下算法。
1. 简单的写文件和读文件
# 写
file1 open(count.txt,w)
file1.write(this is a test)
file1.close()# 读
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print(file2.read())2. 将列表内容写入文本文件
# 生成100-500数字列表
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pri…
FASTA序列格式说明
FASTA序列格式说明 高通量测序数据常采用 FASTQ 格式来保 存所测的碱基读段和质量分数。
如图 所示,FASTQ 格式以测序读段为单位存 储,每条读段占 4 行,
其中第一行和的第三行由文件识别标志和读段名(ID)组成(第一行以“”开头而第三行以“”开头;
第三行中 ID 可以省略,但“…
cath数据库fasta备注_数据库（同源）搜索软件 FASTA 和 BLAST
FASTA和BLAST是目前功能最全，使用最广的同源性数据库搜索软件包。它们在Needleman 的动态算法的基础上做了很多技术上的改进, 如采用启发性算法, 使得在精确度牺牲较小的情况下, 速度快了很多。 FASTA 是 D.J. Lipman and W.R. Person 在1985年提出一个全局联配算法…
cath数据库fasta备注_ncbi nr 数据库提取fasta
在nr库这里挣扎许久了。数据库太大，下载和建库都很困难。下载了nr blast库，拆分更容易下载，但是没搞定blast版本的更新，下载的是5的库，软件还是4？尝试从库里抽提fasta自己建库(用新版的blast，默…
linux系统fasta程序,快速计算fasta序列长度的方法
最近看了一下进入PLoB的网页来路分析，看到有同学搜索计算fasta序列长度。其实自己在之前的数据分析中也遇到过相关的问题，这里给大家分享两种我常用的方法。 方法一：linux下用awk计算fasta序列的长度 前面发表一篇文章《用awk和sed快速将fast…
linux系统fasta程序,fasta格式文件处理大全（一）
前面我们介绍了fastq格式文件的处理，大概有20多个案例，掌握了这些案例，后面拿到fastq格式之后就可以根据需求，使用合适的软件工具进行处理了，从这次内容开始，我们将逐渐介绍fasta格式文件的处理。相比于fastq格式，fasta格式处理更加容易。 1 文件格式介绍 FASTA文件主要…
C#与生物信息学：FASTA序列的比对与分析
🔥关注墨瑾轩，带你探索编程的奥秘！🚀 🔥超萌技术攻略，轻松晋级编程高手🚀 🔥技术宝库已备好，就等你来挖掘🚀 🔥订阅墨瑾轩，智趣学习不孤单🚀 🔥即刻启航，编程之旅更有趣🚀 嘿，各位科学探险家们，👋！今天我们要潜入一个既神秘又充满活力的领域——…
云平台 | 如何根据序列ID提取fasta序列
爱基百客云平台小工具使用
1.1 爱基百客云平台小工具之根据序列ID提取fasta里的序列
1.2 参数设置
1.3 结果
01
爱基百客云平台小工具使用 首先，打开爱基百客官网：http://www.igenebook.com；点击菜单栏最右侧“云平台”按钮。 弹出云…
各类生信文件解读（fasta,fastq,bam,sam,bed,bg,wig,bdg,gff3,gtf等）
目录 各类生信文件官方解读手册经典文件格式解读1. fasta统计序列信息 2. fastq统计序列信息 3. sam与bamsam或bam文件查看sam，bam，fasta，fastq文件转换解决samtools将sam文件转换为bam文件时多条重复错误的方法：Duplicate entry …