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云平台 | 如何根据序列ID提取fasta序列

爱基百客云平台小工具使用 1.1 爱基百客云平台小工具之根据序列ID提取fasta里的序列 1.2 参数设置 1.3 结果 01 爱基百客云平台小工具使用 首先,打开爱基百客官网:http://www.igenebook.com;点击菜单栏最右侧“云平台”按钮。 弹出云…

各类生信文件解读(fasta,fastq,bam,sam,bed,bg,wig,bdg,gff3,gtf等)

目录 各类生信文件官方解读手册经典文件格式解读1. fasta统计序列信息 2. fastq统计序列信息 3. sam与bamsam或bam文件查看sam,bam,fasta,fastq文件转换解决samtools将sam文件转换为bam文件时多条重复错误的方法:Duplicate entry …

【生信】常见测序数据格式

【生信】常见测序数据格式 文章的文字与图片全部/部分来源网络或学术论文,文章会持续修缮更新,仅供大家学习使用。 目录 【生信】常见测序数据格式 1、FASTA 2、FASTQ 3、GFF 4、BED 5、SAM/BAM 6、VCF 在生物信息学中,由于不同数据…

FASTA 与 FASTQ格式详解

FASTA 1.FASTA存储什么? fasta存储核酸序列(DNA/RNA),也存储蛋白质的核苷酸序列(Animo Acid sequence,简称AA序列) 2.FASTA包含什么内容? 第一行:以“>”开头主要…

生物信息学知识

第一篇 基础知识 第一章 基本概念 第一节 生物信息学文件格式 生物信息学——常见的四种文件格式(fasta, fastq ,sam vcf) 从某种意义上来说,生物信息分析的过程就是进行各种文件格式的转换过程。例如当前很多分析都可以概括为从fastq -> bam&#xff0c…

生物学研究必备!FASTA(Fast-All)在云峦操作系统配置指南

目录 1 概述 2 安装环境 2.1 操作系统环境 2.2 工具版本 3 安装与测试 3.1 安装FASTA 3.2 使用测试 1 概述 浪潮信息KOS是浪潮信息基于Linux Kernel、OpenAnolis等开源技术自主研发的一款服务器操作系统,支持x86、ARM等主流架构处理器,性能和稳定…

Scala 下载安装配置

1)安装步骤 (1)首先确保 JDK1.8 安装成功 (2)下载对应的 Scala 安装文件 scala-2.12.11.zip (3)解压 scala-2.12.11.zip,我这里解压到 D:\Tools (4)配…

Scala01 —— Scala基础

目录 Scala 01 —— Scala基础一、搭建Scala开发环境安装Scala编译器在IDEA中进行scala编码 二、Scala简介与概述Scala简介Scala概述Scala代码规范 三、理解Scala变量与数据类型Scala的变量与常量Scala和Java变量的区别 Scala的数据类型 四、Scala的程序逻辑1.表达式2.运算符中…

Intellij IDEA创建Scala项目

一、下载Intellij IDEA插件Scala 二、安装Scala SDK https://www.scala-lang.org/download/ 建议下载*.zip文件,免安装,然后把scala目录下的bin目录添加到系统路径,这样cmd输入scala就可以启动 scala -version --> 查看版本 scala --&g…

scala安装与使用

文章目录 一、scala简介(一)scala概述(二)Scala特性1、一切都是对象2、一切都是函数3、一切都是表达式二、安装Scala1、到Scala官网下载Scala三、配置Scala环境变量1、查看Scala版本, 测试Scala是否安装成功2、启动Scala,执行语句四、Linux上安装Scala(一)到Scala官网下…

Spring Boot进阶(77):开启Scala之门:用Spring Boot轻松整合Scala

📣1. 前言 Scala是一种基于JVM的编程语言,它融合了面向对象编程和函数式编程的优点,同时也具有强大的类型推断能力和高阶函数等先进特性,因此在企业级应用开发中得到了广泛的应用。 Spring Boot是一个快速开发框架,它的宗旨是使Spring应用程序的开发变得更加简单…

Eclipse集成scala-maven-plugin插件

1.概述 scala-maven-plugin 这个插件是用来让maven能够编译、测试、运行scala项目的&#xff0c; 使用文档参考&#xff1a;scala-maven-plugin 2.使用插件 <plugin><groupId>net.alchim31.maven</groupId><artifactId>scala-maven-plugin</arti…

Scala安装和开发环境配置教程

开发环境&#xff1a; jdk1.8IntelliJ IDEA 2018Scala2.11.12 1、Scala语言概述 Scala语言概述&#xff1a;Scala语言是一门以Java虚拟机为运行环境&#xff0c;支持面向对象和函数式编程的静态语言&#xff0c;java语言是面向对象的&#xff0c;所以代码写起来就会相对比较…

Scala的安装与配置

Scala安装配置及介绍 一、为什么要学Scala 1. Scala介绍 Scala基于JVM&#xff0c;和Java完全兼容&#xff0c;同样具有跨平台、可移植性性好、方便的垃圾回收等特性是一门函数式编程语言Scala更适合大数据的处理Scala对集合类型数据处理有非常好的支持spark的底层用Scala编…

Eclipse Scala环境的配置

前言 要开发Scala程序, 一般使用的IDE主要有3种: NetBeanEclipseIDEA 由于个人不太习惯IDEA的一些使用功能, 已经只能打开一个项目.(这可太蠢了.) 所以, 继续选择在Eclipse IDE上集成Scala IDE. 当然, 官方提供了Scala IDE, 可以直接使用. 但是, 如果你之前哟一个版本的Ecli…

Scala 插件安装

说明&#xff1a;在ieda开发scala有两个条件&#xff1a; 一是本地安装了scala,scala安装参考 二是 idea 需要安装scala插件&#xff0c;就是本文的安装步骤。 默认情况下 IDEA 不支持 Scala 的开发&#xff0c;需要安装 Scala 插件。 两种安装方式&#xff1a;1&#xff…

Scala - Idea 项目报错 Cannot resolve symbol XXX

一.引言 Idea 编译 Scala 项目大面积报错 Cannot resolve symbol xxx。 二.Cannot resolve symbol xxx 1.问题描述 Idea 内的 Scala 工程打开后显示下述异常&#xff1a; 即 Scala 常规语法全部失效&#xff0c;代码出现大面积红色报错。 2.尝试解决方法 A.设置 Main Sourc…

scala项目创建

#简介 1、为什么学习scala? 答&#xff1a;实时数仓却不了spark,spark离不开scala、也就是你也是不学习spark也就不用学习scala&#xff0c;因为有其他编程语言可以代替它。 2、特点 答&#xff1a; 1&#xff09;是一门多范式语言&#xff0c;支持面向对象和函数式编程。 2&a…

scala 流计算之 aggregate()

函数参数详解 def aggregate[B](z: >B)(seqop: (B, A) > B, combop: (B, B) > B): BB: 函数返回结果的数据类型&#xff1b;z&#xff1a;聚类前的参数的初始化值&#xff1b;seqop&#xff1a;是用于序列运算的运算符&#xff0c;用于计算所述集合中每个元素的总和&a…

Scala下载和配置

1、前往Scala官网 Scala官网&#xff1a; https://www.scala-lang.org/ 2、点击INSTALL前往下载页面 3、下拉找到PICK A SPECIFIC RELEASE&#xff08;选择特定版本&#xff09;点击前往 4、选择版本&#xff0c;为了使用稳定且兼容开发这里选择Scala2.12.11 5、找到对应的环…