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VBM后的配对t检验以及xjview使用

之前写了VBM后的双样本t检验,再记录一下配对t检验。 配对t检验和双样本t检验的过程基本一致。包括以下三个步骤。 第一步输入两组被试时,应该成对输入,共有几个被试就有几个pair。 但是这里我在做的过程中没有加协变量,不知道会不会有很大的影响。后面再重新做了看看。 接下…

如何提取差异脑区的灰质体积与临床量表算相关?——基于体素的形态学方法(VBM)

基于体素的形态学方法(VBM)是分析大脑解剖学(结构)差异最常用方法之一, 其通过给大脑volume逐体素打标签(分类)的方式来进行组织分割,过程高度自动化,比传统的基于ROI先验假设的分析方式得到的结果,更加具有稳定性和可重复性。VBM可以定量地测量出脑组织中各组织成分的…

基于CAT的VBM和SBM计算学习笔记(二)感兴趣区(ROI)全脑体积(TIV)

前言 回顾一下上文:之前学习了用CAT计算VBM灰质体积的预处理过程,主要分为三步: Preprocessing:从使用DPABI生成T1图像再校准T1原点。Segement:CAT软件自带的自动化分割。Smooth:最后用Spm进行平滑操作。 基于CAT的VBM和SBM计算学习笔记&am…

VBM后的双样本t检验

上一篇文章写到做完了VBM,做完后因为数据一般都是患者组和HC组,这两个组之间需要进行比较,那么我们就要进行双样本t检验。 这里介绍双样本t检验的做法。 依然使用的是SPM-fMRI。 1.第一步是选择Specify 2nd-level 打开以后我们可以看到这个界面,Directory就选择自己准备保…

基于cat12和SPM12进行VBMSBM数据分析笔记1——数据预处理

前言 今年是小编步入研究生生活的第一年,研究方向待定,但主要以磁共振成像为主,以后会不断地总结这方面的知识,涉及MRI,数据分析基础方法理论,软件操作教程,文献阅读笔记总结等等,用…

基于cat12和SPM12进行大脑VBM数据分析笔记2——统计分析

小白一顿操作猛如虎——拿下VBM的双样本t检验 前言 培训的deadline到了,小编需要交作业了,所以就在此先把笔记记下来。作业需要提交一个报告,but这个报告我应该如何写呢,培训总结?哎,现在还是不清楚&…

解析脑神经影像中常用的两种分析方法:ROI和VBM

背景 磁共振成像(Magnetic Resonance Imaging, MRI),是一种非侵入性的医学影像技术,用于生成具有高分辨率的人体内部结构图像,主要包括反应功能网络的功能磁共振成像(Functional Magnetic Resonanc…

VBM4D读后感

VBM4D读后感 本文题目:Video denoising using separable 4-D nonlocal spatiotemporal transforms; 发表时间:2011年; 关键字(自己填的):non-local; block track; BM3D; spatiotemporal 一、背…

基于DPABI进行独立样本t检验计算VBM的组间差异

前言 经过前面两天的学习,我们已经得到了每位被试标准化后的全脑体素灰质体积的图像,以及其全脑(TIV)等信息,可用作组间比较。具体流程可参考前文: 基于CAT的VBM和SBM计算学习笔记(一&#xff…

VBM3D算法简介

目录 ​​​​​​​文章介绍 算法流程 试验中试验的一些参数 文章介绍 论文名称:VIDEO DENOISING BY SPARSE 3D TRANSFORM-DOMAIN COLLABORATIVE FILTERING 论文地址:https://webpages.tuni.fi/foi/GCF-BM3D/VBM3D_EUSIPCO_2007.pdfhttps://webpages.…

vbm 分析_MRI脑影像分析从哲学到技术:一文搞懂VBM预处理基本原理(全网最详细解析)...

基于体素的形态学方法(voxel-based morphometry, VBM),是分析大脑解剖学(结构)差异最常用方法之一。 其通过给大脑volume逐体素打标签(分类)的方式来进行组织分割(segmentation),过程高度自动化,比传统的基于ROI先验假设的分析方式(manual ROI tracing)得到的结果,更加具有…

基于cat12和SPM12进行VBM数据分析

一、基于cat12和SPM12进行VBM数据分析 VBM 能定量计算局部灰质体素的大小和信号强度,从而能够检测出局部脑 区的特征和脑组织成分的差异。 1.前期软件安装准备: 1.1 spm12和cat12软件安装 参考这篇文章操作: https://blog.csdn.net/qq_…

使用VBM和SBM在皮质形态分析中的优势

基于表面形态学测量(SBM)对于估计皮质形态的指数非常有用,例如体积、厚度、面积和沟回指数,而基于体素的形态学测量(VBM)是一种典型的灰质(GM)体积测量方法,包括皮层测量…

MRI脑影像分析从哲学到技术:一文搞懂VBM预处理基本原理(全网最详细解析)

基于体素的形态学方法(voxel-based morphometry, VBM),是分析大脑解剖学(结构)差异最常用方法之一。 其通过给大脑volume逐体素打标签(分类)的方式来进行组织分割(segmentation&…

基于CAT的VBM和SBM计算学习笔记(一)VBM

前言 基于体素的形态学方法(voxel-based morphometry, VBM),是大脑结构研究中最常见的指标。我刚开始学习fMRI数据处理时主要都聚焦在功能差异的研究,但接触了一批受外伤的被试,对其脑结构的改变产生兴趣,遂学习之。 VBM用T1计算&…

VBM_DARTEL算法对灰质变化的计算

根据一些文献得知,VBM目前比较新的算法是DARTEL算法,这一算法被集成在SPM里,这里记录一下做法。 VBM是对T1像进行分割得到灰质等。所以要有结构T1加权像数据。 整个流程应该是这样: 1.手动调整前联合(AC) 首先就是需要我们自己手动调整一下结构像,打开SPM,spm首页有P…

跟着CTF-Wiki学pwn|格式化字符串(1)

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gdb 查看是否 栈溢出_64位Linux栈溢出教程

0x01 这一系列的文章目的在于快速介绍对缓冲区溢出(在64位下linux二进制程序)弱点的利用。 该系列教程适合人群为:熟悉利用32位二进制程序并想应用它们的知识来利用64位二进制程序。 该教程是长期的零散笔记,整理总结成的结果。 搭建环境 在64位与32位li…

C/C++ 基础栈溢出及保护机制

来源:pandolia 整理:CPP开发者 https://www.jianshu.com/p/47d484b9227e 【导读】:缓冲区溢出非常危险,因为栈空间内保存了函数的返回地址。该地址保存了函数调用结束后后续执行的指令的位置,对于计算机安全来说&…