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什么是降维分析?PCA,NMDS,RDA?

PCA分析大家都说是数据的降维,这样说太笼统了,导致懂的人都懂,不懂的人一头雾水。 PCA其实就是能实现多个指标的合并,将若干指标通常合并为PC1,PC2两个指标,也就是我不管你是5个还是8个还是100个指标我做完PCA分析后都…

1、NMDS非度量多维尺度分析作图(R)

导入VOTU.txt , 每列为不同的样本,每行为不同的vOTU 导入分组文件,此处有两种分组方式。后续分别按颜色和形状分类 library(ggplot2) library(vegan) # 读取NMDS数据文件 df read.delim("C:/Users/Shizhe Zhang/Desktop/VOTU.txt",header T,…

利用NMDS对药物处理下肠道菌群微生物群落多态性分析

title: “利用NMDS对药物处理下肠道菌群微生物群落多态性分析” author: “Yang” date: “2021/5/12” output: html_document 背景知识:NMDS 非度量多维尺度分析(Non-metric multidimensional scaling,NMDS)是一种将多维空间的研究对象简化…

R语言绘制NMDS图

非度量多维标度(Non-metric Multidimensional Scaling,NMDS)是一种将多维空间的研究对象(样本或变量)简化到低维空间进行定位、分析和归类,同时又保留对象间原始关系的数据分析方法。 与PCoA相似,NMDS都使用样本相似性距离矩阵进行降维排序分析,但NMDS侧重反映距离…

221.Beta多样性PCoA和NMDS排序

Beta多样性与PCoA和NMDS排序 本节作者:文涛,刘永鑫 版本1.0.4,更新日期:2020年6月27日 本项目永久地址:https://github.com/YongxinLiu/MicrobiomeStatPlot ,本节目录 221BetaPCoA,包含R markdo…

非度量多维排列 NMDS (Non-metric multidimensional scaling)分析

多维排列 (Multidimensional scaling,MDS)是可视化多变量样品(如多个物种丰度、多个基因表达)相似性水平的一种方法。其基于距离矩阵进行一系列的排序分析。 经典的MDS (CMDS)分析就是前面提到的PCoA分析,也称为度量性MDS分析。而与之相对的是非度量多维排列 (Non-m…

可视化绘图技巧100篇分析篇(一)-数据降维NMDS分析(补充篇)

目录 前言 算法原理 什么是NMDS分析? NMDS与其他降维方式有什么区别? 距离算法为何会影响排序结果? PCA添加环境因子与RDA有何区别? NMDS分析的推荐步骤 实现过程 NMDS排序图内加聚类分析结果 参数设置 绘图工具 R语言 实战NMDS分析 NMDS分析展示群落beta多样…

R统计绘图-NMDS、环境因子拟合(线性和非线性)、多元统计(adonis2和ANOSIM)及绘图(双因素自定义图例)

这个推文也在电脑里待了快一年了,拖延症患者,今天终于把它发出来了。NMDS分析过程已经R统计-PCA/PCoA/db-RDA/NMDS/CA/CCA/DCA等排序分析教程中写过了。最近又重新看了《Numerical Ecology with R》一书,巩固一下知识,正好重新整理了一下发出…

跟着iMeta学做图|NMDS分析展示群落beta多样性

原始教程链接:https://github.com/iMetaScience/iMetaPlot/tree/main/221108NMDS 写在前面 非度量多维尺度分析(Non-metric multidimensional scaling, NMDS),是基于相异矩阵或距离矩阵进行排序分析的间接梯度分析方法,在微生物组研究中可以用…

NFT Insider #73:淡马锡将领投Animoca Brands新一轮1亿美元融资

引言:NFT Insider由WHALE社区、BeepCrypto联合出品,浓缩每周NFT新闻,为大家带来关于NFT最全面、最新鲜、最有价值的讯息。每期周报将从NFT市场数据,艺术新闻类,游戏新闻类,虚拟世界类,其他动态类…

Forward 与 Redirect 的区别

目录 一、定义不同 二、请求方式不同 三、数据共享不同 四、最终URL地址不同 总结 一、定义不同 请求转发(Forward):发生在服务端程序内部,当服务器端收到一个客户端的请求之后,会先将请求,转发给目标…

Win10系统FF新推荐怎么卸载?FF新推荐新闻弹窗彻底关闭删除教程

几乎所有的电脑中都会安装Flash Player,不过随着技术的不断变革,Flash Player将于2020年12月被默认禁用,即将禁用的这段时期,利用Flash Player的占用量疯狂吸金,而FF新推荐弹窗就是Flash Player的,那么Win1…

FF新闻、头条新闻等开机弹出的广告删除办法

虽然加了广告过滤器,但是还是很烦 每次写着东西突然窗口弹出来,然后被弹窗管理kill掉 这些都是软件带的,ff是Adobe Flash,头条新闻是搜狗输入法带的 虽然只有一秒,还是很不顺眼 先解决FF新闻这沙雕广告 在弹出ff新…

利用MDK的FLM文件生成通用flash驱动

文章目录 前言一、FLM文件是什么?二、FLM文件结构1.FlashPrg.c2.FlashPrg.c 三、解析FLM文件1.解析flm文件 四、设计flash驱动抽象层五、快速使用 前言 在进行Flash操作时,一般我们需要设计一套Flash抽象层,至少要包括flash的init&#xff0…

FLASH模拟EEPROM的方法

工业中经常使用EEPROM(电可擦除可编程存储器)来存储更新数据,为降低成本,可以使用FLASH代替。 EEPROM 仿真可以通过多种方式实现,但要注意 Flash 限制和产品要求。下面详述的方法要求为非易失性数据分配至少两个相同大…

通透理解FlashAttention(含其2代和第3代):全面降低显存读写、加快计算速度

前言 成就本文有两个因素(首发于23年10月,修订于24年5月) 第一个因素是,我带长沙的LLM项目团队做论文审稿GPT这个项目时,遇到了不少工程方面的问题(LLM方面的项目做多了,你会逐步发现,现在模型没啥秘密 技术架构/方向…

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对nandflash存储原理不了解的请先阅读《 flash memory技术 》 架构图 ----------- 系统总线 ------------------- CLE,io [8:0] ----- -------------- | cpu |←------------→| nand控制器| ←--------------→| nand flash | ----------- -----…

STM32 --- 使用内部FLASH存储数据

本文记录了对一些知识点的理解、操作方法,如有错误,请务必批评指正!! 最终的测试截图: 目录​ 一、内部FLASH要点 关于地址: 关于解锁: 关于擦除: 关于写入: 二…

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GD32F103读写内部FLASH 测试环境: GD32F103C820KBytes RAM64KBytes FLASH 2021年11月24日10:01:49更新,修复擦除FLASH的bug,具体在: 应改为: 感谢评论区 qq_29872523和蜗牛爬上屋顶啦两位提醒~! 头文件 …

AM335x SPI Flash烧写启动说明

本文主要描述如何在EVB335X-II上实现从SPI Flash启动系统,包括启动方式的修改,u-boot编译,SPI Flash的烧写。EVB335X-II使用的SPI Flash型号为W25Q32FV,大小为4M-Byte,挂载在SPI0总线上。以下为功能实现步骤。 一 修改…