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16S预测宏基因组最强R包-Tax4Fun
之前在公众号的文章《根据16S预测微生物群落功能最全攻略》阅读人数近3000人，有需求的用户还是非常多的。其中提到了4个软件，之前已经介绍了其中非常有特点的三种，分别为： - PICRUSt预测宏基因组： 优点是高引流行&…
新技能Get!宏基因组分析结果导入qiime2分析和可视化
最近读微生态公众号中宏基因组的文章，发现阿童木写的教程，宏基因组的数据可以导入qiime2分析。于是有了发现新大陆的感觉，qiime2是一个优秀的可视化工具，有它在手，分析不愁呀，可是作者并没有给出怎样导入数…
易基因｜综述：单细胞DNA甲基化分析方法全介绍及未来发展前景预测
大家好，这是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。
2021年07月10日，《Biomolecules》杂志上发表一篇关于单细胞表观测序的综述文章，详细介绍了单细胞DNA甲基化的实验策略、分析方法、数据分析以及相关科研应用并讨论…
微生物组统计和可视化——phyloseq入门
翻译：文涛 写在前面: 最近一段时间面临着各种各样的问题和挑战，总在寻求一种可以权衡，理解的解释的解决之道。 phyloseq：使用R语言分析微生物群落(microbiome census data) 目前对微生物群落的分析有许多挑战：使用生态…
随手“一片”SCI，Qiime2扩增子处理流程确定不了解一下？
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QIIME 2教程. 10数据导出Exporting data(2020.11)
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QIIME 2教程. 10数据导出ExportingData(2021.2)
QIIME 2用户文档. 10数据导出 https://docs.qiime2.org/2021.2/tutorials/exporting/ Exporting data 注：最好按本教程顺序学习，想直接学习本章，至少完成本系列1简介和安装。 为了使用QIIME 2，输入数据必须存储在QIIME 2对象&…
16s功能注释Bugbase的安装使用--本地版
文章目录 概述介绍下载安装程序下载并配置环境安装依赖R包并显示帮助运行示例数据Bug及解决方法-☆ 使用输入文件准备-☆下载Greengenes数据库在QIIME2中操作R语言操作 运行Bugbase 结果解读 概述
Bugbase依赖于Greegenes1与R
但是R现已更新到4.4以上，安装R包时会…
数据分析：扩增子分析（qiime2平台全流程分析）
Amplicon sequencing analysis pipeline through qiime2 platform
qiime2是扩增子数据分析的最佳平台之一，其提供了大量从原始data到统计分析的插件，尤其是它的可重复分析且可扩展插件的理念使得其成为扩增子分析首选的平台。
Platform
qiime2是扩增子…
kraken2注释+braken格式转换
由于最近遇到一个宏基因项目，第一次分析注释到的物种数目较少，因此更换数据库试试看看！
于是kraken上榜，OK，lets try 一下子！
前提是已经安装了kraken和braken，运行命令比较简单
1.注释
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生物信息学练习2- Biom-format
The Biological Observation Matrix (BIOM) format http://biom-format.org/ biom-format有两种方式安装： 1. python pkg: pip install numpy 由于最新版的biom-format还不支持python3，所以需要切换到python2 sudo update-alternatives --config python …
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BIOM格式文件_微生物组数据通用数据格式
生物观测矩阵（Biological Observation Matrix，BIOM）是微生物组数据通用数据格式（The Biological Observation Matrix (BIOM) format — biom-format.org），BIOM格式的表称为biom表，一般使用.biom…
BIOM：生物观测矩阵——微生物组数据通用数据格式
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QDateTime类的部分函数使用解析
QDateTime类提供了日期和时间功能。 QDateTime对象包含一个日历日期和一个时钟时间（一个“日期时间”）。它是QDate和QTime两个类的组合。它可以从系统时钟中读取当前日期时间。它提供比较日期时间和操作日期时间的函数，比如加上一定数量的秒…
【Qt开发教程】日期时间处理QDateTime类详解及实战应用：用于创建、操作和格式化日期时间对象，适用于需要精确处理日期和时间的场景，如日志记录、时间戳、日历应用等
QDateTime 提供了一种简单而强大的方式来处理日期和时间数据，通过其丰富的日期时间运算和格式化方法，可以在 Qt 应用程序中方便地进行日期时间处理。合理使用 QDateTime 类，可以简化日期时间操作、提高代码的可读性和维护性。在处理复杂时间计…
QDateTime时间相减
qDebug()<<"span"<<QDateTime::fromMSecsSinceEpoch(QDateTime::currentDateTime().toMSecsSinceEpoch() - time.toMSecsSinceEpoch()).toUTC().toString("hh:mm:ss");
1、使用 QDateTime::toMSecsSinceEpoch 计算时间差； 2、使用…
第四章 QTime、QDate、QDateTime和QCalendarWidget
目录
参考：
一、表示日期时间数据的类
1. QTime类
2. QDate类
3. QDateTime类
4. 日期时间数据与字符串的转换 二、日期时间数据的界面组件
1. QDateTimeEdit及其子类
2. QCalendarWidget类 三、代码实现 参考： 《Qt6 C开发指南》 具体代码实现看…